Još od same najave za System Shock 3, oduševljeni fanovi su dosta puta zaredom bivali razočarani raznim problemima u razvoju i ponovnim odlaganjima.
Igra je već nekoliko puta interno odlagana, a dodatni kamen spoticanja u razvoju je bila i finansijska situacija studija Starbreeze, koji je bio primoran da proda prava na ovu igru, čime je vlasništvo prešlo na OtherSide Entertainment.
Problemi za System Shock 3 time nisu prestali, već su se sada pojavili i novi, koji otkrivaju da je ovaj naslov u ozbiljnim problemima. Kako otkriva portal VGC, glavni razvojni tim, koji je godinama radio na System Shock 3, je sada raspušten od strane studija Otherside. Izvori iza ove objave su poprilično kredibilni, pošto dolaze od strane ljudi koji su radili na igri i koji su otpušteni, poput kreativnog producenta, Čejsa Džonsa.
Izvori su naveli i da je potencijalni razlog za raspuštanje razvojnog tima to što se dosta kasnilo po pitanju sadržaja, do čega je došlo zbog mnogih drugih nedostataka. Otherside Entertainment još uvek nije pružio objavu povodom otpuštanja developera, ali situacija svakako nije obećavajuća.
Mnogi fanovi su se ponadali da će System Shock 3 uskoro ugledati svetlost dana, pošto smo prošle godine dobili par tizera i trejlera, zbog čega smo pomislili da ima napretka u razvoju.